Туберкулез диагнозы һәм наркотикларга каршы торуны ачыклау өчен яңа корал: Туберкулезга сизгерлек диагнозы өчен машина өйрәнү белән кушылган яңа буын максатчан эзлеклелек (tNGS).
Әдәбият отчеты: CCa: tNGS һәм машина өйрәнү нигезендә диагностик модель, ул бактерия туберкулезы һәм туберкулез менингиты аз кешеләр өчен яраклы.
Диссертация исеме: Туберкулезга юнәлтелгән киләсе буын эзлеклелеге һәм машина өйрәнү: тыныч үпкәләр һәм трубка менингиты өчен ультра сизгер диагностика стратегиясе.
Вакытлыча: 《Клиника Чимика Акта》
IF : 6.5
Басылган вакыты: 2024 елның гыйнвары
Кытай Фәннәр Академиясе Университеты һәм Капиталь Медицина Университетының Пекин Күкрәк Хастаханәсе белән берлектә, Макро & Микро-Тест туберкулезга диагностикалау моделен булдырдылар, яңа буын максатчан эзләү (tNGS) технологиясе һәм машина өйрәнү ысулы нигезендә ультра югары аз бактерияләр һәм туберкулез менингиты булган туберкулезны ачыклау сизгерлеге, ике төр туберкулезга клиник диагностикалау өчен яңа сизгерлек диагностикалау ысулы белән тәэмин итте, һәм туберкулезны төгәл диагностикалауга, наркотикларга каршы торуны ачыклауда һәм дәвалауда булышты.Шул ук вакытта, пациентның плазмалы cfDNA TBM диагностикасында клиник үрнәк алу өчен яраклы үрнәк төре буларак кулланылырга мөмкинлеге ачыкланды.
Бу тикшеренүдә ике клиник корт булдыру өчен 227 плазма үрнәге һәм цереброспиналь сыеклык үрнәкләре кулланылды, аларда туберкулез диагностикасының машина өйрәнү моделен булдыру өчен лаборатория диагностик когорт үрнәкләре кулланылды, һәм клиник диагностик когорт үрнәкләре билгеләнгәннәрне тикшерү өчен кулланылды. диагностик модель.Барлык үрнәкләр дә Микобактерия туберкулезы өчен махсус эшләнгән максатчан тоту бассейны белән тупланган.Аннары, TB-tNGS эзләү мәгълүматларына нигезләнеп, карар агач моделе лаборатория диагностик чиратының укыту һәм тикшерү комплектларында 5 тапкыр кросс-тикшерү үткәрү өчен кулланыла, һәм плазма үрнәкләренең диагностик чикләре һәм цереброспиналь сыеклык үрнәкләре алына.Алынган бусага ачыклау өчен клиник диагностик чиратның ике сынау җыелмасына китерелә, һәм укучының диагностик күрсәткечләре ROC сызыгы белән бәяләнә.Ниһаять, туберкулез диагностикасы моделе алынды.
Тикшеренү дизайнының схематик схемасы
Нәтиҗә: CSF ДНК үрнәге (AUC = 0.974) һәм плазмалы cfDNA үрнәге (AUC = 0.908) буенча, 227 үрнәк арасында, CSF үрнәгенең сизгерлеге 97,01%, спецификасы 95,65%, һәм плазма үрнәгенең сизгерлеге һәм үзенчәлеге 82,61% һәм 86,36% иде.ТБМ пациентларыннан плазмалы cfDNA һәм цереброспиналь сыеклык ДНКның 44 парлы үрнәген анализлаганда, бу тикшерүнең диагностик стратегиясе плазмалы cfDNA һәм цереброспиналь сыеклык ДНКсында 90,91% (40/44) югары эзлеклелеккә ия, һәм сизгерлек 95,45%. (42/44).Pulпкә туберкулезы булган балаларда, бу тикшерүнең диагностик стратегиясе плазма үрнәкләренә шул ук пациентларның ашказаны суы үрнәкләрен ачыклау нәтиҗәләренә караганда сизгеррәк (28.57% VS 15.38%).
2 нче рәсем. Туберкулезга диагностикалау моделенең халык үрнәкләре өчен анализы
Парлы үрнәкләрнең диагностик нәтиҗәләре
Йомгаклау: Бу тикшеренүдә туберкулез өчен гиперсенсив диагностикалау ысулы булдырылды, ул диагностик коралны олигобациллар туберкулезы (тискәре культура) булган клиник пациентлар өчен иң югары ачыклау сизгерлеге белән тәэмин итә ала.Плазма cfDNA нигезендә гиперсенсив туберкулезны ачыклау актив туберкулез һәм туберкулез менингиты диагнозы өчен яраклы үрнәк булырга мөмкин (плазма үрнәкләрен баш ми туберкулезында шикләнелгән пациентлар өчен цереброспиналь сыеклыкка караганда җиңелрәк).
Оригиналь сылтама: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/s0009898123004990?% 3Dihub аша
Макро & Микро-Тест туберкулез сериясен ачыклау продуктларын кыскача кертү
Туберкулез пациентларының катлаулы үрнәк ситуациясен һәм төрле ихтыяҗларны исәпкә алып, Macro & Micro-Test какырык үрнәкләреннән сыекландыру, Квалкомм китапханәсе төзелеше һәм эзлеклелеге, мәгълүмат анализы өчен NGS чишелешләренең тулы комплектын тәкъдим итә.Продукция туберкулез пациентларына тиз диагностикалау, туберкулезга наркотикларга каршы тору, микобактерия туберкулезы һәм НТМ язу, бактерия-тискәре туберкулез һәм туберкулез кешеләренә сизгерлек диагнозы һ.б.
Туберкулез һәм микобактерия өчен серияләрне ачыклау комплектлары:
.К пункт | продукт исеме | продукт сынау эчтәлеге | үрнәк төре | кулланыла торган модель |
HWTS-3012 | Releaseрнәк чыгару агенты | Балыкчы үрнәкләрен сыекландыруда кулланылган, 20230047 Сутонг машиналары җиһазлары беренче класслы рекорд номерын алды. | балчык | |
HWTS-NGS-P00021 | Гиперсенсив туберкулез өчен квалком күләмен ачыклау комплекты (тикшерү ысулы) | Бактерия-тискәре үпкә туберкулезы һәм баш мие түгәрәкләре өчен инвазив булмаган (сыек биопси) сизгерлекне ачыклау;Туберкулез яки туберкулез булмаган микобактерия белән зарарланган кешеләр үрнәкләре югары тирәнлектәге метагеномика белән анализланган, һәм туберкулез яки туберкулез булмаган микобактерия зарарланганмы, микобактерия туберкулезының беренче чираттагы наркотикларга каршы торуы. белән тәэмин ителде. | Периферик кан, альвеолар лава сыеклыгы, гидроторакс һәм асцитлар, фокус пункция үрнәге, цереброспиналь сыеклык. | Икенче буын |
HWTS-NGS-T001 | Микобактерия язу һәм наркотикларга каршы торуны ачыклау комплекты (мультиплекс көчәйтү эзләү ысулы) | Микобактерия язу тесты, шул исәптән MTBC һәм 187 NTM;Микобактерия туберкулезын наркотикларга каршы тору 13 препаратны һәм наркотикларга каршы геннарның 16 төп мутация мәйданын үз эченә ала. | Балыкчы, альвеолар лава сыеклыгы, гидроторакс һәм асцитлар, фокус пункция үрнәге, цереброспиналь сыеклык. | Икенче / өченче буын икеләтә платформа |
Игътибарлы вакыйгалар: HWTS-NGS-T001 Микобактерия язу һәм наркотикларга каршы торуны ачыклау комплекты (мультиплекс көчәйтү ысулы)
Продукция белән таныштыру
Продукция БСО туберкулезын дәвалау принципларында, макролидларда һәм аминогликозидларда тасвирланган төп беренче һәм икенче чираттагы препаратларга нигезләнгән, һәм наркоманиягә каршы тору урыннары наркоманиягә каршы сайтларның бер төркемен үз эченә ала. БСО Микобактерия туберкулез комплекслы мутация каталогы, шулай ук илдә һәм чит илдә югары балллы әдәбият тикшерүе һәм статистикасы буенча наркотикларга каршы геннар һәм мутация сайтлары.
Тип язу идентификациясе НТМ штаммнарына нигезләнеп, Кытай туберкулез һәм сулыш авырулары журналы тарафыннан бастырылган һәм белгечләр консенсусы нигезендә бастырылган.Дизайнланган праймериз 190-тан артык НТМ төрен көчәйтә, эзлекле итә һәм аңлатма бирә ала.
Максатлы мультиплекс PCR көчәйтү технологиясе ярдәмендә, Микобактериянең генотиплау геннары һәм наркотикларга чыдам геннары мультиплекс PCR ярдәмендә көчәйтелде, һәм максатлы геннарның ампликон кушылмасы табылды.Күчерелгән продуктлар икенче буын яки өченче буын югары үткәргеч эзлекле китапханәләргә төзелергә мөмкин, һәм барлык икенче буын һәм өченче буын эзләү платформалары максатлы геннарның эзлеклелеге турында мәгълүмат алу өчен югары тирәнлектә эзләнергә мөмкин.Эчке белешмә мәгълүмат базасында булган билгеле мутацияләр белән чагыштырганда (БСО Микобактерия туберкулез комплекслы мутация каталогын һәм аның наркотикларга каршы торуы белән), наркотикларга каршы тору яки туберкулезга каршы препаратларның сизгерлеге белән бәйле мутацияләр билгеләнде.Макро & Микро-Тестның үз-үзен ачкан балчык үрнәген дәвалау чишелеше белән берлектә, клиник балчык үрнәкләренең түбән нуклеин кислотасын көчәйтү эффективлыгы проблемасы (традицион ысуллардан ун тапкыр югарырак) чишелде, шуңа күрә наркотикларга каршы эзлеклелекне ачыклау мөмкин. турыдан-туры клиник балчык үрнәкләренә кулланыла.
Продукцияне ачыклау диапазоны
34наркоманиягә каршы геннар18туберкулезга каршы препаратлар һәм6НТМ препаратлары ачыкланган, каплаган297наркотикларга каршы урыннар;Микобактерия туберкулезының ун төре һәм аннан да күбрәк190НТМ төрләре ачыкланды.
Таблица 1: 18 + 6 Наркотиклар + 190 + НТМ турында мәгълүмат
Продукция өстенлеге
Көчле клиник адаптация: балчык үрнәкләрен культурасыз үз-үзен сыекландыручы агент белән ачыкларга мөмкин.
Эксперименталь операция гади: көчәйтү эшенең беренче туры гади, һәм китапханә төзелеше 3 сәгать эчендә тәмамлана, бу эш нәтиҗәлелеген күтәрә.
Комплекслы язу һәм наркотикларга каршы тору: клиник борчылуның төп нокталары булган, MTB һәм NTM-ның язу һәм наркотикларга каршы тору урыннарын каплау, төгәл язу һәм наркотикларга каршы торуны ачыклау, бәйсез анализ программаларын хуплау, һәм бер басу белән анализ отчетлары ясау.
Сөйләшү: продуктның яраклашуы, төп агым ILM һәм MGI / ONT платформаларына яраклашу.
Продукция спецификасы
Продукция коды | продукт исеме | Ачыклау платформасы | спецификацияләр |
HWTS-NGS-T001 | Микобактерия язу һәм наркотикларга каршы торуны ачыклау комплекты (мультиплекс көчәйтү ысулы) | ONT 、 Illumina 、 MGI 、 Salus pro | 16 / 96rxn |
Пост вакыты: 23-2024 гыйнвар