Чжэцзян провинциясендә Brucella abortus-ның беренче тулы геном нигезендәге күзәтүчәнлек анализы - Macro & Micro-Test биоинформатика командасы берлектә бастырып чыгаруга өлеш кертә

—— Zhejiang CDC, Macro & Micro-Test һәм China CDC тарафыннан оештырылган берлектәге тикшеренү Frontiers in Cellular and Infection Microbiology журналында бастырылган.

Өйрәнүгә гомуми күзәтү

2026 елның маенда Frontiers in Cellular and Infection Microbiology (JCR Q1, IF ≈ 4.6) Чжэцзян провинциясенең Авыруларны контрольдә тоту һәм профилактикалау үзәге (Zhejiang CDC) җитәкчелегендә, Beijing Macro & Micro-Test Bio-Tech Co., Ltd. биоинформатика командасы һәм Милли йогышлы авыруларны контрольдә тоту һәм профилактикалау институты (China CDC) автордашлары булган мәкалә бастырып чыгарды. Тикшеренүнең исеме:
"Кытайның Чжэцзян провинциясендә җиде Brucella abortus штаммын идентификацияләү һәм филогенетик анализлау."
Бруцелла абортусы

Бу тикшеренү Кытайның Чжэцзян провинциясендә Brucella abortus (B. abortus) бактериясенең беренче системалы, тулы геномга нигезләнгән филогенетик күзәтү анализы булып тора. Команда 2015 елдан 2025 елга кадәр җыелган җиде изолятны анализлады (Дүрт кеше чыгышлы һәм өч сыер чыгышлы штамм Цзиньхуа, Цючжоу һәм Нинбодан). Нәтиҗәләр бу "төньяк доминант төр"нең Кытайның көнчыгышындагы атипик көньяк эпидемия төбәгендә килеп чыгышы һәм таралу юллары турында геном дәлилләре бирә.

 

Фон һәм әһәмият

 

Бруцеллез - Brucella ыругындагы бактерияләр китереп чыгаручы зооноз авыру. Brucella abortus, нигездә, терлекләрне зарарлый, ләкин кешеләрдә дә авыру китереп чыгарырга мөмкин. Кытайда бруцеллез географик яктан шактый төрле: иң югары очрак төньяк провинцияләрдә (мәсәлән, Эчке Монголия, Шаньси, Хэйлунцзян) күзәтелә. Киресенчә, көньяк провинцияләрдә, шул исәптән Чжэцзянда, Brucella melitensis тарих буенча өстенлек иткән, B. abortus очраклары бик аз теркәлгән. Бу төбәк аермасы Чжэцзяндагы B. abortus генетик характеристикасын һәм чыганакларын эзләүне җәмәгать сәламәтлеге өчен төп өстенлекле бурыч итә.

 

Методлар һәм төп нәтиҗәләр

Тикшеренү төркеме молекуляр биология һәм биоинформатиканы берләштергән күп юнәлешле стратегия кабул итте:

1.Патогенны ачыклау һәм төп типлаштыру

BCSP-31 генының ПЦР һәм AMOS-ПЦР нәтиҗәләре җиде изолятның барысы да B. abortus булуын раслады.

Тугыз хуҗалык генына нигезләнгән Multilocus секвенция типлаштыру (MLST) барлык изолятларның да ST2 секвенция тибына керүен күрсәтте, бу Чжэцзяндагы кан әйләнешендәге B. abortus штаммнары арасында югары генетик бер төрлелекне күрсәтә.
Патогенны ачыклау һәм төп типлаштыру

2.Геномның тулы характеристикасы

Бөтен геном секвенирлавы Illumina NovaSeq платформасында башкарылды. Уртача нуклеотид охшашлыгы (ANI) анализы Чжэцзян изолятларының B. abortus 544 эталон штаммы белән 99,99% ка кадәр охшашлык күрсәтүен күрсәтте.

Пан-геном анализы югары дәрәҗәдә сакланган популяцияне күрсәтте: 3084 үзәк ген ачыкланды, шулай ук ​​бары тик 10 кабык гены гына, һәм йомшак үзәк яки болыт геннары табылмады.

图片 1

 

3.Вирулентлык һәм антимикробларга каршы торучанлык геннары профильләре

Барлыгы 68 вирулентлыкка бәйле фактор фаразланды, алар LPS биосинтезы, T4SS секреция системасы һәм BvrR-BvrS ике компонентлы көйләү системасы кебек классик юлларны үз эченә алды. Шунысы игътибарга лаек, барлык изолятларда да bmaA һәм btaF адгезин геннары юк иде. Каршылык генын анализлау CARD мәгълүмат базасында бары тик mprF генын гына ачыклады, башка каршылык детерминантлары ачыкланмады.

Вирулентлык4. Филогенетик реконструкция һәм тапшыруны күзәтү

Үзәк-геном бер нуклеотидлы полиморфизм (cgSNP) анализы Чжэцзян изолятларын глобаль филогенетик агачта билгеле бер урынга куйды. Нәтиҗәләр Чжэцзян штаммнарының Россия, Монголия һәм берничә төньяк Кытай провинцияләреннән (Нинся, Хэйлунцзян, Эчке Монголия, Хэбэй, Ганьсу, Пекин) алынган штаммнар белән бергә монофилетик төркем тәшкил итүен күрсәтте. Бу төркем тагын өч аерым субкладка бүленә (1–3 клад), бу күп санлы бәйсез интродукция вакыйгаларын күрсәтә.

Филогенетик реконструкция

Йомгаклаулар һәм нәтиҗәләр

 

Бу тикшеренү Чжэцзян провинциясендә B. abortus турында беренче югары төгәллекле геном мәгълүматлары җыелмасын тәкъдим итә һәм берничә төп нәтиҗә бирә:

 

  1. Клеar генетик фон– Чжэцзянда әйләнештә йөрүче B. abortus штаммнары ST2 га карый, геномик яктан югары дәрәҗәдә сакланган һәм типик сыер бруцеллезы нәселен күрсәтә.

 

2. Эвитөбәкара тапшыру тизлеге– Филогенетик анализ Чжэцзяндагы бәйсез эндемик нәселнең булуын расламый. Киресенчә, мәгълүматлар бу штаммнарның Төньяк Кытайдан килеп чыкканлыгын һәм Россия һәм Монголия штаммнары белән уртак эволюцион фонга ия булуын күрсәтә. Өч субкладның булуы берничә аерым интродукция вакыйгасын күрсәтә.

 

3. Җәмәгать сәламәтлегенә йогынтысы– Бу ачышлар бруцеллезны геном күзәтүенең Чжэцзян кебек традицион рәвештә эндемик булмаган төбәкләрдә дә әһәмиятен ассызыклый. Хәзерге вакытта авыру очраклары саны аз булса да, cgSNP кебек югары сыйфатлы кораллар чит илдән китерелгән авырулар чыганагын нәтиҗәле рәвештә күзәтә һәм провинцияләр арасындагы терлек ташу белән бәйле тапшыру чылбырларын өзү өчен фәнни дәлилләр бирә ала.

 

Бу эш Чжэцзян провинциясендәге тикшеренү бушлыгын тутырып кына калмый, ә Янцзы елгасы дельтасы төбәгендә патогеннарны күзәтү һәм бруцеллез куркынычын бәяләү өчен яңа башлангыч мәгълүматлар бирә.

 

Кәгазь турында мәгълүмат:
Yang, Y., Shi, X., Chen, J., Wang, L., Wu, Z., Yao, W., … & Wu, B. (2026). Кытайның Чжэцзян провинциясендә җиде Brucella abortus штаммын ачыклау һәм филогенетик анализлау. Cellular and Infection Microbiology журналында чикләр, 16, 1758965.

 

 


Бастырылган вакыты: 2026 елның 10 июне